Панюков Валерий Васильевич, Киселев Сергей Сергеевич, Зимин Андрей Антонович

АНАЛИЗ МЕТОДОВ ГЕНОМНОЙ КЛАССИФИКАЦИИ БЛИЗКОРОДСТВЕННЫХ TLS-ПОДОБНЫХ БАКТЕРИОФАГОВ, ПЕРСПЕКТИВНЫХ ДЛЯ ТЕРАПИИ СЕЛЬСКОХОЗЯЙСТВЕННЫХ ЖИВОТНЫХ
(текст статьи)

DOI:10.34617/rpsz-9257

Аннотация: Бактериофаги рассматриваются в качестве перспективных средств для терапии сальмонеллёзов сельскохозяйственных животных, обработки продуктов животноводства и кормов. В данной работе исследована таксономия 12 TLS-подобных фагов с помощью методов полногеномного анализа. Показано, что подход, основанный на попарном сравнении геномов и расчёте расстояний между ними, можно использовать для реконструкции филогении близкородственных бактериофагов.

Ключевые слова: k-меры; классификация; бактериофаги

Список литературы:
1. Chen Y., Sun E., Song J., Tong Y., Wu B. Three Salmonella enterica serovar Enteritidis bacteriophages from the Siphoviridae family are promising candidates for phage therapy // Can. J. Microbiol. – 2018. – 64:865-875.
2. Kumar S., Stecher G., Li M., Knyaz C., Tamura K. MEGA X: Molecular Evolutionary Genetics Analysis across computing platforms // Mol. Biol. Evol. – 2018. – 35:1547-1549.
3. Sorensen T. A method of establishing groups of equal amplitude in plant sociology based on similarity of species content // Kongelige Danske Videnskabernes Selskab. Biol. krifter. — 1948. – 4:1-34.