Зимин Андрей Антонович, Скобликов Николай Эдуардович

НЕСТРУКТУРНЫЙ БЕЛОК ВИРУСА ИНФЕКЦИОННОЙ АНЕМИИ КУР ИМЕЕТ СХОДСТВО С БЕЛКАМИ ФАГОВ СЕМЕЙСТВА MICROVIRIDAE (текст статьи)

DOI: 10.34617/tyd5-z704

Аннотация: в данном эволюционном исследовании  проведен поиск гомологов неструктурного белка вируса CAV, на следующем этапе построено филогенетическое дерево гомологов этого белка у бактериофагов семейства Microviridae. Показано, что белок CAV находится в центре дерева его гомологов из вирусов бактерий, что указывает на возможность ложноположительных ответов при иммуноферментном обнаружении вируса за счет взаимодействия антител к вирусу с белками фагов-микровирусов.

Ключевые слова: неструктурный белок вируса CAV; филогенетическое дерево гомологов; бактериофаги семейства Microviridae; ложноположительный  ответ ИФА; белки фагов-микровирусов.

Список литературы:
1. Virus Taxonomy: The Classification and Nomenclature of Viruses. The 9th Report of the ICTV (2011) https://talk.ictvonline.org/ictv-reports/ictv_9th_report/ Дата обращения 11.09.2019
2.  Altschul, S.F., Madden, T.L., Schäffer, A.A., Zhang, J., Zhang, Z., Mille,r W., Lipman, D.J. Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search programs. // Nucl. Acids Res. 1997. V. 25. P. 3389–3402.
3. Сайт http//www.ncbi.nlm.nih.gov Дата обращения 09_09_2019.
4. Tamura, K., Stecher, G., Peterson, D., Filipski, A., and Kumar S. MEGA6: Molecular Evolutionary Genetics Analysis version 6.0. // Mol. Biol. and Evol. 2013. V. 30. P. 2725–2729.
5. Jones, D.T., Taylor, W.R., and Thornton, J.M. The rapid generation of mutation data matrices from protein sequences. // Computer Appl. in the Biosciences. 1992. V. 8. P. 275–282.
6. Felsenstein, J. Confidence limits on phylogenies: An ap-proach using the bootstrap. // Evolution. 1985. V. 39. P. 783–791.