В лаборатории микробиологии отдела токсикологии и качества кормов ФГБНУ КНЦЗВ проводятся научные исследования по двум основным направлениям:

  – Изучение применения в кормлении сельскохозяйственных животных и птицы  кормовых добавок на основе пробиотических микроорганизмов, в т.ч. препаратов, обогащенных биологически активными нутриентами (микроэлементами) для улучшения роста и развития животных и получения от них мясного сырья высокого качества для функционального питания. На основании проведенных исследований изданы методические рекомендации «Применение кисломолочных заквасок в кормлении свиней для профилактики заболеваний и повышения качества мясного сырья» (2011);
  – Изучение бактериально-фаговой микроэкологической системы E. сoli пищеварительного тракта сельскохозяйственных животных и птицы, а также исследование применения фаговых препаратов, конструируемых  на основе нетрансдуцирующих колифагов при эшерихиозах у сельскохозяйственных животных и птицы.
  На основании результатов  проведенных иммледований предложена "Методика коррекции микробиологического статуса кишечной микрофлоры животных с помощью фагового препарата на основе нетрансдуцирующих бактериофагов E. Сoli"(2017). Данное направление исследований поддержано грантами РФФИ.