Скобликов Николай Эдуардович, Кузнецов Евгений Олегович, Мараховская Татьяна Алексеевна, Иванченко Анастасия Александровна

РЕШЕНИЕ ПРОБЛЕМЫ ОПРЕДЕЛЕНИЯ ДЛИНЫ ГОМОПОЛИМЕРНЫХ УЧАСТКОВ В ТЕХНОЛОГИИ ИОННОГО ПОЛУПРОВОДНИКОВОГО СЕКВЕНИРОВАНИЯ (текст статьи)

DOI:10.34617/f7ta-4j87

Аннотация: Изложена вероятная причина проблемы определения длины гомополимерных участков при проведении полупроводникового секвенирования – локальная полимеризация высвобождающегося пирофосфата в более длинные полифосфатные цепочки. Предложены технологические решения по минимизации влияния образующегося полифосфата на детектируемые изменения pH.
Работа выполнена частично при поддержке РФФИ и Администрации Краснодарского края в рамках научных проектов 19-44-230030 р_а и 19-44-230040 р_а.

Ключевые слова: секвенирование, гомоповторы, полифосфаты.

Список литературы:
1. Kulaev I.S., Vagabov V., Kulakovskaya T.V. (2004). The Biochemistry of Inorganic Polyphosphates. Wiley – 276 p.
2. Rothberg J., Hinz W., Bustillo J. (2011). An integrated semiconductor device enabling non-optical genome sequencing. Nature, 475:348–352.